关键词:
ATF3
ARL4C
乳腺癌
抑癌基因
DNA甲基化
摘要:
背景:乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,在世界范围内发病率呈逐年上升的趋势,严重威胁广大女性的生命健康。尽管目前人们对乳腺癌疾病的认识逐步深入,以手术为主的抗肿瘤综合治疗日臻成熟,乳腺癌死亡率有所下降,但是全球患病女性人数仍然逐年增长。因此,对乳腺癌分子机制的研究至关重要。转录激活因子3(Activating Transcription Factor 3,ATF3)是一种适应性反应基因,其参与多种细胞生物学过程,与诸多疾病的发生和发展密切相关。目前关于ATF3在乳腺癌中的研究相对较少并且存在争议,ATF3被认为既可发挥促癌作用,又能够充当抑癌基因。ATF3调控乳腺癌的具体分子机制尚未完全明确。目的:本文以ATF3为研究对象,探究其在乳腺癌中的作用,并进一步寻找ATF3的下游靶蛋白及其发挥作用的分子机制。方法:1、对TCGA数据库中1053例乳腺癌患者与109例癌旁正常组织中的ATF3的表达情况进行差异分析,并通过Kaplan-Meier法研究ATF3表达水平对乳腺癌总生存(Overall survival,OS)的影响;实时定量聚合酶链反应(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)、免疫印迹(Western blot,WB)和免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)验证乳腺癌组织与细胞株中ATF3的表达量。2、通过慢病毒稳定转染构建稳定过表达ATF3的MDA-MB-231与MDA-MB-435细胞株,通过体外细胞增殖,细胞周期、细胞凋亡、细胞迁移与侵袭实验以及构建裸鼠乳腺脂肪垫下移植瘤模型,验证高表达ATF3后乳腺癌生物学行为的改变。3、采用Pearson相关性分析寻找与ATF3存在共表达关系的基因,分析其表达情况并结合转录因子预测数据库TRANSFAC 2.0的预测结果,锁定候选目标蛋白,随后采用qRT-PCR、Western blot进行表达验证。进一步通过虫荧光素酶报告实验和染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)实验对ATF3及其目标靶蛋白之间的关系进行验证。4、通过甲基化特异性PCR(MSP)实验研究ATF3是否受甲基化调控。5、最后根据上述结果,通过慢病毒稳定转染构建稳定过表达下游靶蛋白的MDA-MB-231与MDA-MB-435细胞株并进行细胞增殖,细胞周期、细胞凋亡、细胞迁移与侵袭以及裸鼠体内成瘤实验,验证该目标靶蛋白在体内、外水平对乳腺癌细胞发挥的生物学功能。结果:1、TCGA公共数据的差异表达分析结果显示乳腺癌患者中ATF3的表达低于癌旁正常组织,并且ATF3的低表达降低乳腺癌患者的OS;qRT-PCR,Western blot,IHC证实临床乳腺癌样本中ATF3较癌旁正常组织低表达。2、通过慢病毒稳定转染成功在乳腺癌细胞系MDA-MB-231与MDA-MB-435中过表达了 ATF3,细胞功能学实验证实ATF3过表达能够显著抑制乳腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并促进乳腺癌细胞的凋亡。裸鼠乳腺脂肪垫下移植瘤成瘤实验显示,过表达ATF3能够显著抑制移植瘤的生长。3、生物信息分析发现ARL4C与ATF3存在共表达关系,qRT-PCR及Western blot证实乳腺癌组织中ARL4C的表达与ATF3正相关,提示ARL4C可能是受ATF3调控的下游靶蛋白。ChIP和荧光素酶实验证实ATF3能够与ARL4C的启动子区直接结合,促进ARL4C的表达,发挥转录因子的功能。从而证实ARL4C受ATF3调控。4、甲基化特异性PCR(MSP)实验揭示了 ATF3在乳腺癌中存在异常高甲基化的现象,且经DNA甲基转移酶抑制剂5-Aza-dC处理后ATF3表达上调,说明ATF3受甲基化调控。5、qRT-PCR,Western blot,IHC实验证实ARL4C在乳腺癌中的低表达,体内、外功能学实验结果表明,在乳腺癌细胞中过表达ARL4C能够抑制其增殖、迁移和侵袭能力,并抑制乳腺癌细胞的体内成瘤能力。结论:ATF3在乳腺癌中低表达,且其低表达与乳腺癌不良预后相关;ATF3能够抑制乳腺癌的增殖、迁移和侵袭能力,发挥抑癌作用;ATF3启动子区存在甲基化位点,其在乳腺癌中的低表达与其超甲基化有关;ARL4C是ATF3的下游靶蛋白,ATF3可作为转录因子结合ARL4C启动子,促进其转录;ARL4C亦在乳腺癌中发挥抑癌基因功能,抑制乳腺癌的增殖、迁移和侵袭能力。本研究初步探讨了 ATF3在乳腺癌中的生物学功能,其作为潜在的预后评估分子指标和治疗靶点,具有一定的临床意义。