关键词： 多杀性巴氏杆菌   荚膜分型   流行病学调查   荧光定量PCR  

摘要： 多杀性巴氏杆菌(***)是一种革兰阴性条件致病菌,能够感染多种宿主,包括人类、伴侣动物、家畜和野生动物,是禽霍乱、牛和水牛及家兔出血性败血病的病原菌,该病的发病率和死亡率很高,往往会导致畜牧业巨大的经济损失。***常与其他病原混合感染,在全国各地均有发生。研究建立***快速检测方法是成功防治的关键措施,故本研究旨在建立*** TaqMan荧光定量PCR(qPCR)检测方法,并对宁夏地区牛羊***进行流行病学调查,研究内容如下:(1)根据NCBI数据库中多杀性巴氏杆菌5种荚膜基因序列(hyaC-hyaD、bcbD、dcbF、ecbJ、fcbD),设计特异性引物和荧光标记探针。通过梯度设置调整退火温度,用矩阵法对引物与探针浓度进行优化,构建质粒,建立标准曲线,进行特异性、灵敏度及重复性试验,最终建立针对这5种基因的多重TaqMan qPCR检测方法。结果显示:建立此方法的灵敏度较高,其中pMD18-hyaC-hyaD检测下限为5.237×102 copies/μL、pMD18-bcbD检测下限为 4.45×102 copies/μL、pMD18-dcbF检测下限为 2.89×101 copies/μL、pMD18-ecbJ检测下限为3.74×102 copies/μL、pMD18-fcbD检测下限为5.68×102 copies/μL,灵敏度比普通PCR高10～100倍;特异性强,以枯草芽孢杆菌、奇异变形杆菌、金黄色葡萄球菌、放射根瘤菌等8种病原菌DNA检测均无扩增曲线;此检测方法具有良好的线性关系,所得线性方程依 次 如 下:y=-3.277x+33.663、R2=0.9984,y=-3.765x+37.397、R2=0.9948,y=-3.869x+35.865、R2=0.9988,y=-3.668x+34.996、R2=0.995,y=-3.769x+35.11、R2=0.9979,组间及组内重复性试验Ct值变异系数均在3%以下,表明建立此检测方法具有较好的重复性。(2)对宁夏同心县、盐池县、原州区等8个县区24个规模化养殖场进行现场流行病学调查,采集了 382份牛羊鼻拭子,通过病原分离及分子生物学检测,分析其荚膜血清学分型,结果显示:分子生物学鉴定共分离到77株***,总阳性率为20.2%(77/382),各地区阳性率为12.7%～34.3%,灵武市阳性率最高为34.3%,同心县阳性率最低为12.7%。对所分离菌株经建立的TaqMan qPCR检测方法进行荚膜血清分型,得到荚膜血清A型44(57%)株,荚膜血清B型29(38%)株,荚膜血清D型4(5%)株。牛羊多杀性巴氏杆菌病发病主要集中在3～8月龄,感染率13%以上。综上所述,本研究针对*** 5种荚膜基因建立了多重TaqMan qPCR检测方法,该方法特异性强、灵敏度高,能够用于***感染的检测和调查;流行病学调查显示,宁夏地区牛羊***感染比较严重。研究结果为***在宁夏的流行病学、疫源追溯、病原鉴定以及科学防控提供了参考。

关键词： 奶牛酮病   发病率   β-羟丁酸   流行病学调查   防控方案  

摘要： 奶牛酮病是奶牛代谢紊乱导致机体能量负平衡而引发的一种代谢性疾病，多发生于围产后期的高产奶牛，其主要生化特征为低血糖、高血酮、高游离脂肪酸等。同时，酮病对奶牛的泌乳性能、繁殖性能及产后恢复能力均造成了巨大的危害，使现代化的规模化奶牛养殖产业蒙受了巨大的经济损失。奶牛酮病的发生与许多因素有着密切的关联,本论文采用流行病学调查的方法研究牧场酮病发生因素及规律，并结合饲喂试验做出相应的酮病预防措施，从而为规模化牧场的酮病防治提供技术指导。　　本文通过收集2021年国内7个不同地区（东北、华东、华中、西北、华北、塞北、西南）中的12个规模化牧场的饲养管理数据，分析不同类型的酮病在牧场中的发病率及季节、区域、产后时间、体况评分、胎次、单产对酮病发病率的影响。结果表明:首先，规模化牧场中亚临床型酮病的发病率占比依旧较大，为36.46％,临床型酮病发病率为5.12％;其次，夏季的酮病发病率最高，达到53.08％,其次是冬季、春季和秋季且春秋两季的酮病发病率大致相同;第三，西南地区的酮病发病率显著高于其他6个地区的酮病发病率，达到44.86％,其次是塞北地区、华北、西北、华中、华东、东北;第四，产后的第二周是奶牛酮病的高发期，发病率达到6.44％,发病率随之降低;第五,从奶牛的个体角度看，奶牛体况评分为.3.25、胎次为第三胎次、产量为12000Kg/头是一个临界值，当奶牛的上述数值超过该临界值时，奶牛的酮病发病率显著升高，且之后酮病发病率的趋势也随之上升。　　采用饲喂试验，对比不同保健剂对奶牛酮病的预防效用、对产后奶牛采食量和单量的影响及不同保健剂的经济效益。结果表明:以过瘤胃胆碱为保健剂的试验组，相较于其他组酮病的发病率更低，为2.63％。过瘤胃胆碱和B族维生素对奶牛产后干物质采食量的恢复，均有显著效果（P＜0.01)。在单产方面，相比于对照组，B族维生素和过瘤胃胆碱均有一定效果，且B族维生素的效果优于过瘤胃胆碱。在经济效益方面，虽然B族维生素成本略高于过瘤胃胆碱，但其产生的经济效益要远高于过瘤胃胆碱。　　综上所述，本文研究结果为规模化牧场的酮病防治提供如下建议:首先，按牧场位置，常年环境温度较高，湿度较大的地区，以过瘤胃胆碱为主要保健剂;其次，按牛群结构，胎次大于3且年奶产量大于12000Kg、体况评分大于3.75的奶牛，在饲料中以添加过瘤胃胆碱为主，在保证奶牛健康和稳定产量的同时，可预防亚临床酮病的发生;牛群胎次小于3且年奶产量小于9001Kg、体况评分小于3.75的奶牛，在饲料中以添加B族维生素为主，既可保证奶牛健康，又能有效提高奶产量;第三，按发病率做好每月牧场中酮病的监测与预警，当酮病发病率大于3％时，以过瘤胃胆碱为主要保健剂;当酮病发病率小于3％时，以B族维生素为主要保健剂;第四，在整个围产期间（产前21d至产后21d）使用过瘤胃胆碱预防酮病，结合产后第22d开始使用B族维生素，可达到增加产量提高经济效益的目的。

关键词： 隐孢子虫   奶牛   肉牛   感染率   基因亚型   PCR   人畜共患  

摘要： 隐孢子虫病是由隐孢子虫引起的一种以腹泻为主要临床表现的呈世界性分布的人畜共患寄生虫病,免疫力正常的宿主可发生自限性腹泻,免疫缺陷的宿主可发生持续性水样腹泻,严重者可导致死亡。隐孢子虫对公共卫生、人类健康和畜牧业的经济发展构成严重威胁。牛作为隐孢子虫的主要宿主,大大增加了隐孢子虫病向人类传播的风险,严重威胁人类健康。山西地区关于牛源隐孢子虫调查研究尚未报道,本研究对山西灵丘和应县规模化养殖场和散户奶牛及肉牛采集的858份新鲜粪便样品,基于隐孢子虫SSU r RNA基因和微小隐孢子虫gp60基因,进行巢式PCR扩增、酶切、测序和序列分析,来确定隐孢子虫的感染情况、感染虫种和微小隐孢子虫基因亚型。结果表明:山西部分地区牛源隐孢子虫总感染率为11.19%(96/858),灵丘和应县牛源隐孢子虫感染率分别为13.30%和8.67%,存在统计学差异(X2=4.595,P<0.05);总体样本中,4个不同年龄阶段牛源隐孢子虫感染率(5.44%～25.78%)之间存在极显著差异(X2=48.739,P<0.001);腹泻牛的隐孢子虫感染率显著高于非腹泻牛的隐孢子虫感染率(X2=8.957,P<0.01);奶牛和肉牛隐孢子虫感染率分别为10.78%和11.50%,统计学差异不显著(X2=0.109,P>0.05)。山西部分地区共检测出5种牛源隐孢子虫,分别为安氏隐孢子虫(***)52.08%(50/96)、牛隐孢子虫(***)31.25%(30/96)、微小隐孢子虫(***)8.33%(8/96)、芮氏隐孢子虫(***)7.29%(7/96)和泛在隐孢子虫(***)1.04%(1/96),奶牛与肉牛均存在前四种隐孢子虫,并存在混合感染情况,此外,奶牛中还存在泛在隐孢子虫,不同品种牛的优势虫种均为安氏隐孢子虫;微小隐孢子虫均鉴定为IId A17G1亚型。本研究首次对山西部分地区奶牛及肉牛隐孢子虫进行研究,并发现该地区牛感染隐孢子虫,同时对微小隐孢子虫基因亚型进行鉴定。研究结果为当地隐孢子虫病的防治奠定了基础。

关键词： 新病毒   蝙蝠   两栖类和鱼类   病毒宏基因组学   分子流行病学  

摘要： [背景]本世纪以来,新发传染病(EmergingInfectious Diseases,EIDs)在全球范围内频发,从SARS到如今的COVID-19疫情,其中大部分是人畜共患病,约70%以上由野生动物来源的病原体引起,为了量化和降低病原体溢出的风险,全球加强对野生动物携带病毒的主动监测,随着基于高通量测序的病毒宏基因组学技术的兴起,病毒的发现方式发生了变革。作为种类和数目上仅次于啮齿类的第二大哺乳动物,蝙蝠具有长途迁徙、超长寿命、群居活动和强大免疫力等生物和生态学特性,能够携带多种人类致病性病原体,如埃博拉病毒,马尔堡病毒、亨尼帕病毒以及冠状病毒等,因此蝙蝠是重要的人畜共患病毒宿主。我国广东省地处亚热带,人口密集,动物资源丰富,是多种自然疫源性疾病的流行地,因此监测该地区蝙蝠携带的病毒对于有效防范蝙蝠源人畜共患病毒的外溢以及防控新发传染病是非常必要的。另一方面,在脊椎动物携带病毒的监测中,经常存在对哺乳动物和鸟类的抽样偏差,而对于在脊椎动物中占比超过75%的低等脊椎动物——鱼类、两栖类和爬行类携带的病毒却知之甚少。近年来的宏病毒组研究已在鱼类、两栖类和爬行类中发现了多种新型病毒,如流感样病毒、冠状病毒和小RNA病毒等,同时这类动物在养殖过程中不免存在与人类、宠物、禽畜和其他野生动物密切接触的可能,具有传播自然疫源性疾病的潜在风险,因此本研究对我国多个地区的两栖类和鱼类携带的病毒谱进行监测,以进一步丰富低等脊椎动物的病毒资源库,并为病毒-宿主共进化提供理论依据。[目的]1.基于高通量测序的病毒宏基因组学了解我国广东地区蝙蝠携带的病毒多样性,对重要病毒进行PCR检测以掌握其流行情况,并通过系统进化分析了解病毒的遗传进化特征,有助于为蝙蝠源人畜共患病毒和新发传染病的防控提供指导意见,具有深远的公共卫生意义。2.通过病毒宏基因组测序了解两栖类和鱼类的病毒群落组成及携带新病毒情况,描述重要病毒的基因组特征并进行系统进化分析,尝试分离病毒并通过PCR检测了解重要病毒的感染分布情况,对于防范食源性传播以及潜在自然疫源性疾病风险具有重要意义。[方法]1.2015年和2019年分别在广东省肇庆市怀集县和河源市东源县的某些洞穴中采集蝙蝠共120只,混合成10个文库后利用华大MGISEQ-200RS测序平台进行高通量测序获得病毒谱。利用PCR方法检测蝙蝠中与人类致病密切相关的病原体的感染情况,并针对重要病原体进行一系列的基因序列和系统进化分析。2.2021年10月到2022年8月于北京、湖北、四川、吉林、辽宁、云南6个省/市采集两栖类7种和鱼类2种,将两栖类的肺、肠、肝和肾分别混合成35个库,鱼类的鳃、肠和肝分别混合成6个库,进行高通量测序获取RNA病毒谱。通过PCR方法扩增获得病毒基因组,并运用生物信息学软件对其进行病毒基因组结构与功能预测、同源性分析和系统进化分析。同时针对重要病毒设计特异性引物进行PCR验证和检测,了解病毒在两栖类或鱼类中的感染分布情况。利用ACTK-1细胞系分离两栖类中鉴定到的新病毒以了解其生物学特性。[结果]1.广东地区蝙蝠携带病毒多样性的分子流行病学特征1.1蝙蝠样本采集结果本研究在广东地区共采集蝙蝠肛拭子120份,蝙蝠经物种鉴定分为3科5属10种,其中大马蹄蝠数量占比最多(63.3%),菊头蝠的种类数最多(n=5),大马蹄蝠是该地区的蝙蝠优势种群。1.2广东地区蝙蝠携带的病毒谱对蝙蝠肛拭子进行宏病毒组测序,获得107.1 GB核苷酸数据,共注释到18个病毒科,哺乳动物病毒科包括星状病毒科、杯状病毒科、小RNA病毒科、黄病毒科、腺病毒科、圆环病毒科、嗜肝病毒科、细小病毒科、痘病毒科和维雅病毒科共10个,以圆环病毒占比最高(29.6%),不同地区的蝙蝠携带的病毒种类存在一定差异,河源蝙蝠具有更广泛的病毒多样性。1.3蝙蝠中4种重要病毒的分子流行病学特征在120只蝙蝠的肛拭子中检测到了冠状病毒、星状病毒、腺病毒和乙肝病毒,流感病毒和副黏病毒检测均为阴性,菊头蝠属和蹄蝠属蝙蝠携带的病毒谱最广。(1)冠状病毒:在菊头蝠和小蹄蝠中各检出一株新型蝙蝠冠状病毒,分别与SADS-CoV和蝙蝠冠状病毒HKU2具有97%以上的核苷酸同源性,在进化树中各自聚集成簇。(2)星状病毒:星状病毒感染率最高(46.7%),在8种蝙蝠中都有检出,不同种类蝙蝠星状病毒感染率的差异具有统计学意义(χ2=30.526,P<0.005)。12株新型蝙蝠星状病毒之间的氨基酸同源性小于90%,系统进化位置各异,表现出高度的遗传异质性。(3)腺病毒:在菊头蝠和大马蹄蝠中各检出一株新型蝙蝠腺病毒,宏病毒组测序组装还获得一条长37,642 bp的蝙蝠腺病毒Bat adenovirus strain A8,这三株新病毒与已知蝙蝠腺病毒DPol蛋白的氨基酸同源性在69.5

关键词： 人呼吸道合胞病毒   流行病学   实验室检测   感染   诊断  

摘要： 前言本文件按照GB/T 1.1—2020 《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。本文件由中华预防医学会提出并归口。本文件起草单位：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家儿童医学中心（北京）/首都医科大学附属北京儿童医院、首都儿科研究所、温州医科大学附属育英儿童医院、

关键词： 儿童患者   肺结核   流行病学   病原学  

摘要： 目的：分析876例儿童肺结核的流行病学及病原学检出率情况，提升诊疗水平，减少漏诊及误诊。　　方法：回顾性分析2016年1月至2020年12月于重庆医科大学附属儿童医院初次确诊或临床诊断为肺结核的876例住院患儿的一般资料、流行病学情况及实验室检查结果。　　结果：　　1.一般资料：共入组876例PTB患儿，男性479/876例（54.68%），女性397/876例（45.32%），男女比例为1.21:1;城镇患儿431/876例（49.20%），农村患儿445/876例（50.80%）;有285/876例（32.53%）有明确的结核接触史，多来源于家庭结核病患者，也有部分来自于密接接触的家庭外的结核感染者。　　2.疾病分组：单纯肺结核组422/876例（48.17%），合并肺外结核组454/876例（51.83%）;重症结核组339/876例（36.30%）,非重症结核组537/876例（63.70%）。　　3.实验室检查：　　（1）免疫学检测：TST阴性者270/797例（33.88%），一般阳性者85/797例（10.66%），中度阳性者139/797（17.44%），强阳性者303/797例（38.01%），其中出现水泡者72例（9.03%）、破溃者1例（0.13%）。T-SPOT的阳性率为91.07%（775/851）。　　（2）细菌学检测：　　1）抗酸染色涂片：阳性率为20.21%（176/871），其中单纯肺结核组和合并肺外结核的阳性率分别为15.68%（66/421）、24.44%（110/450）。　　2）MTB培养：阳性率为28.43%（224/788），其中单纯肺结核组和合并肺外结核组的阳性率分别为22.37%（85/380）、34.07%（139/408）。　　MTB培养的阳性率（28.43%）要高于抗酸染色涂片的阳性率（20.21%），差异有统计学意义（?2=15.276，P＜0.001）。　　（2）分子生物学方法：　　1）XpertMTB/RIF：阳性率为28.95%（141/487），利福平耐药率为2.46%（12/487），其中单纯肺结核阳性率为17.84%（43/241），利福平耐药0.83%（2/241）;合并肺外结核阳性率为39.84%（98/246），利福平耐药4.07%（10/246）。　　2）TB-DNAPCR：阳性率为19.42%（129/664），单纯肺结核组和合并肺外结核组阳性率分别为15.24%（50/328）、为23.51%（79/336）。　　Xper的阳性率（28.95%）要高于TB-DNAPCR的阳性率（19.42%），差异有统计学意义（?2=14.196，P＜0.001）。　　单种检查方法、联合两种检查方法、联合三种检查方法、联合四种检查方法的合并病原学检出率分别为23.84%（670/2810）、35.20%（1015/2883）、45.21%（779/1730）、52.48%（169/322例）。联合两种以上检查方法的病原学检出率较单种检查方法的病原学检出率高，且联合的检查方法越多，病原学检出率越高，差异有统计学意义（P＜0.05）。　　（3）病理学方法：①病理学诊断：114例行病理活检，形态学提示结核者100/114例（87.72%）;②分子病理学诊断：组织活检标本中有41例行TB-DNAPCR检测，阳性率为87.80%（36/41）。　　4.多因素二元logistic回归分析显示，年龄＜3岁、居住于农村、未接种卡介苗或接种史不详是重症肺结核发生的独立危险因素[OR（95%CI）=2.977（2.128~4.166）、OR（95%CI）=1.928（1.446~2.571）、OR（95%CI）=1.987（1.301~3.034）]　　结论：　　1.本研究显示肺结核患儿男性多于女性，但女性患儿有增多趋势;农村多于城镇，城镇就诊患儿有增加趋势;农村重症结核病占比明显高于城镇;发病高峰为7~12岁，其次为12~15岁。　　2.本研究中，不同年龄段PTB患儿结核接触史差异有统计学意义（P＜0.05），其中7岁以下患儿的结核接触史占比较高，尤其是0~1岁年龄段，多为密切接触家庭结核病患者。　　3.目前抗酸染色涂片仍被广泛使用，Xpert在儿童结核病中的诊断价值越来越被重视。虽然儿童结核病的病原学检出率较低，但是免疫学检测方法（如TST和T-SPOT）及病理活检的诊断阳性率较高，此外联合多种检查方法也可提升病原学的检出率。对于儿童TB，应综合其临床表现、接触史及尽可能多的联合各种检查方法实现早诊断、早治疗，改善预后及生存率。　　4.年龄＜3岁、居住于农村、未接种卡介苗是重症结核发生的独立危险因素（P＜0.05），儿童重症结核率总体呈下降趋势。

关键词： 脊柱侧凸   海拔   学生   流行病学调查  

摘要： 【目的】调查云南省大理白族自治州中小学生疑似脊柱侧凸检出率,初步探究不同海拔地区儿童青少年脊柱侧凸患病的影响因素。【方法】以学校为筛查地点,采用目测法、Adams前屈试验结合躯干旋转测量仪测量躯干旋转角度,于2021年9至11月对大理8县380所中小学共176729名6～18岁学生进行脊柱健康普查,将躯干旋转角≥5°或目测法复测阳性作为阳性标准筛查出疑似脊柱侧凸人群。收集筛查人群的姓名、性别、年龄、民族等人口学资料,详细记录筛查地区社区或乡村委员会所在地海拔高度,测量记录所在地相对应的重力加速度、气压、氧含量,通过筛查地区的政府官方网站或气象网站收集记录2019至2021年的年平均气温、年日照时间数据,采用二分类logistic回归分析筛选脊柱侧凸的影响因素。【结果】计划完成筛查人数为176729名,实际完成人数为140026名,完成率79.23%;共检出疑似脊柱侧凸阳性3190名,检出率为2.28%;女性检出率2.52%,高于男性的2.03%(χ=37.18,P<0.001);10～18岁人群检出率2.90%,高于6～9岁人群的0.70%(χ=620.79,P<0.001);6岁至18岁各年龄段受检人群检出率差异有统计学意义(χ=1451.00,P<0.001)。汉族检出率2.67%,高于非汉族人群的2.15%(χ=31.06,P<0.001);在非汉族人群中,白族人群检出率2.07%,低于非白族人群的2.26%(χ=4.02,P=0.045)。趋势χ检验显示,在海拔高度各组间,总体人群、10～18岁人群和6～9岁脊柱侧凸检出率的差异有统计学意义(χ=249.02、195.64、24.46,P<0.05),而在海拔高度相关因素中,重力加速度、年平均气温、气压、氧含量、年日照时间各组组间,疑似脊柱侧凸检出率的差异有统计学意义(χ=219.82、106.56、153.57、213.87、132.55,P<0.001)。二分类变量logistic回归分析显示,男性相对于女性,发生脊柱侧凸的风险偏低(OR=0.83,P<0.001),6-18岁中小学生随年龄增长,发生脊柱侧凸的风险增加(OR=1.21,P<0.001),白族相对于汉族,发生脊柱侧凸的风险偏低(OR=0.76,P<0.001),重力加速度增加,发生脊柱侧弯的风险降低(OR=0.01,P=0.010),海拔高度≥2000m是脊柱侧凸患病的危险因素(OR=1.25,P=0.001),年平均气温≥15.6℃是脊柱侧凸患病的危险因素(OR=1.19,P<0.001),年日照时间≥2076h是脊柱侧凸患病的保护因素(OR=0.76,P<0.001),气压及氧含量无统计学差异(P>0.05)。基于疑似脊柱侧凸阳性人群,对比不同海拔高度组,ATR10-19°和ATR≥20°在海拔2000m以上人群占比高于海拔2000m以下人群(7.53%vs5.91%,0.52%vs 0.47%,P=0.223),ATR 5-9°在海拔2000m以上人群占比低于海拔2000m以下人群(91.95%vs93.62%,P=0.223);对比不同年龄组,ATR5-9°和ATR≥20°在6-9岁人群占比高于10-18岁人群(97.44%vs92.05%,1.47%vs 0.41%,P<0.001),ATR10-19°在6-9岁人群中显著低于10-18岁人群(1.10%vs 7.54%,P<0.001)。Spearman相关性分析结果显示,ATR度数与海拔高度存在弱相关关系(rs=0.080,P<0.001)。【结论】云南省大理州中小学生疑似脊柱侧凸的检出率为2.28%,并且女性、年龄增长、汉族、居住地海拔≥2000m的群体可能面临更高的脊柱侧凸患病风险。与海拔相关的因素中重力加速度减小、年平均气温≥15.6℃是脊柱侧凸发生的危险因素,而年日照时间≥2076h是脊柱侧凸发生的保护因素。此外,海拔高度差异可能会影响区域内患者脊柱侧凸严重程度。

关键词： 新型冠状病毒感染   SEIR   场景模拟   调查表定制   呼吸系统疾病  

摘要： 目的:新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 19,COVID-19)疫情对人类健康和社会、经济的发展造成了严重的危害,对公共卫生领域造成了严重威胁,疫情发展趋势直接关乎全国人民乃至全球人民的健康。将疫情有效遏制依赖于对疫情风险和未来发展趋势的了解,依赖于对流行病学调查现场信息的快速获取并采取及时有效的防控措施。根据流行病学调查获取信息确定疾病的病因、传染源、传播途径、易感人群以及危险因素,对疫情流行趋势进行预测是疫情防控极为重要的工作。因此,构建针对新型冠状病毒感染不同场景的预测模型并探索不同的流行病学调查方法非常必要。本研究立足疫情防控的实际,依托传染病模型为应对新型冠状病毒感染疫情或突发传染病疫情防控对策的制定提供有效的工具。依托先进的软件技术为获取流行病学调查现场信息提供方便快捷的工具。方法:本研究中收集的扬州市2021年7月28日至8月26日570例实验室确诊病例的相关信息来自中华人民共和国国家卫生健康委员会(国家卫健委)和当地卫生健康委员会,包括人口统计学特征(患者的年龄、性别、居住地、就诊地点)、接触史、密切接触者、临床类型、关键时间点(核酸检测日期、隔离日期、诊断日期等)和活动路径、棋牌室的位置等信息。所有这些信息都用于改进的易感-暴露-感染-移除(Susceptible-Exposed-Infected-Recovered,SEIR)模型和基于智能体的模型的构建和在不同场景下不同防控政策的效果模拟。病例报告表(Case Report Form,CRF)技术、人机交互信息采集(humancomputer interaction,HCI)及决策推荐框架用于流行病学调查表定制系统的构建,流行病学调查人员可以根据不同需求定制、发放调查表,受访人员可以进行流行病学调查信息的填写和文件上传。咳嗽声纹检测模型的数据通过通信智能机器人人机语音交互技术收集,包括患者(临床诊断患有呼吸系统疾病)和健康人(非呼吸系统疾病)在内的605份咳嗽声记录,用于构建卷积循环神经网络(Convolutional Recurrent Neural Network,CRNN)模型的训练验证,作为呼吸系统疾病的筛查工具。结果:1.扬州疫情不同场景模拟本次疫情中共感染570人,改进的SEIR模型对扬州市大场景的疫情模拟结果显示,对于来自中高风险地区的人员,出行前3天内的核酸检测可以将扬州的感染者总数限制在50人;在老年人中,当老年人疫苗接种率提高到30%时,扬州的感染者总数将减少119人,当60岁以上人群的疫苗接种率提升到60%时,感染者总数将会减少253人。基于智能体的模型对以棋牌室为代表的小场景模拟结果显示,棋牌室将有75人感染,当棋牌室的人口密度下降40%时,感染人数将在7天内减少54人;当棋牌室的通风量从25%增加到50%时,在7天内感染总数将减少33人;当通气量从25%增加到75%时,在7天内感染总数将减少63人。2.流行病学调查表定制系统本研究实现了对流行病学调查表进行定制的功能,管理人员通过系统对现有的调查表进行管理。被调查人员通过链接或者扫描二维码进行调查表的填写和文件上传。流行病学调查人员可以根据疾病、事件等不同调查场景的需求对调查表进行定制和发布,可以对调查数据进行浏览、修改、删除、查询、分析和导出等。3.呼吸系统疾病筛检模型模型对呼吸系统疾病的模拟质量显示准确率为96.61%,精确率、召回率和F1分数均为90%。通过将模拟结果与临床诊断的“金标准”比较,灵敏度和特异度分别为90%和97.95%。结论:本研究构建了针对不同场景的新型冠状病毒感染疫情模拟模型、流行病学调查表定制系统,可以实现疾病初期的筛检、发展过程中的流行病学调查和疫情趋势模拟,可以为传染病防控提供强有力的工具。1.针对大场景的疫情防控措施模拟表明核酸检测时间与出行日期之间的间隔越短,检测效果越好,建议出行前一日进行核酸检测;扬州疫情的发病前期以老年人为主,建议在保证安全的前提下扩大疫苗策略对年龄的限制,应倡导为健康的老年人接种疫苗;针对小场景的疫情防控措施模拟提示小场景内应增加通风量,增大社交距离。2.流行病学调查表定制系统可以实现前方与后方数据的顺利传输,使后方专家通过系统更直观地了解流行病学调查现场的实际情况,并对前方流行病学学调查人员开展的调查工作进行及时准确地指导,实现现场调查和疫情处置的有效开展。3.呼吸系统疾病筛检模型准确率高,可以通过训练实现对肺部疾病的识别,为呼吸系统疾病的早期筛查以及可能出现的突发呼吸道传染病提供诊断思路。

关键词： 原发性肺癌   手术   流行病学   病理类型  

摘要： 【目的】回顾性分析2013年-2022年在昆明医科大学第三附属医院(云南省肿瘤医院)胸外一科、胸外二科接受手术治疗的15967例原发性肺癌患者的临床资料,分析近10年云南及周边地区肺癌手术患者的流行病学特点,为云南及周边地区肺癌的防治工作提供科学参考。【方法】收集2013年-2022年在昆明医科大学第三附属医院(云南省肿瘤医院)胸外一科、胸外二科行手术治疗肺癌患者的临床资料,对患者的一般资料、手术信息、TNM分期、肺癌病理分型等临床流行病学特点进行统计分析。【结果】1、共收集符合纳排标准的病例15967例,2018年以后病例数快速增长。2、男性7389例,女性8578例,男女性别比例在(0.68-1.61:1)之间波动,不同年份男女性别构成存在显著差异(P<0.01)。3、年龄的中位数56(49,63)岁,50-59岁年龄段患者占比最高,2017年以来,60岁以下患者占比在逐年增长,不同年份年龄构成存在显著差异(P<0.01)。4、BMI中位数22.76(20.76,24.91)kg/m,BMI正常(18.5-23.9 kg/m)的肺癌手术患者占比最高(59.5%)。不同年份BMI构成存在显著差异(P<0.01)。5、曲靖市6145例(38.5%)和昆明市3448例(21.6%)是病例数分布前两位的地区,不同年份地区分布存在显著差异(P<0.01)。4351例(29.3%)的云南省患者来自宣威、富源地区。6、吸烟患者4483例(28.1%),未吸烟患者11456例(71.9%),吸烟患者比例从33.5%下降至21.2%,不同年份吸烟情况分布存在显著差异(P<0.01)。7、右肺癌9354例(58.6%),左肺癌6480例(40.6%),双肺癌133例(0.8%)。单一肺叶病变分布为:右肺上叶4509例(28.2%)、右肺中叶1001例(6.3%)、右肺下叶3216例(19.8%)、左肺上叶3624例(23.0%)、左肺下叶2619例(15.6%),不同年份发病部位构成存在显著差异(P<0.01)。8、胸腔镜手术占比从30.8%增加至96%,单孔胸腔镜手术9793例(61.3%),不同年份手术技术构成存在显著差异(P<0.01)。9、肺叶切除术10245例(64.2%),肺楔形切除术2745例(17.2%),肺段切除术1944例(12.2%)、涉及多个肺叶的手术(袖式、全肺、楔形/肺段/肺叶中的至少两种)1033例(6.5%),肺叶切除术占比从83.1%下降至46.1%,不同年份手术方式构成存在显著差异(P<0.01)。10、0期1004例(6.4%),Ⅰ期10191例(63.8%),Ⅱ期1832例(11.5%),Ⅲ期2240例(14.0%),Ⅳ期694例(4.3%)。0-Ⅰ期占比从43.5%上升至82.8%,Ⅱ-Ⅳ期占比从56.5%下降至17.2%,不同年份TNM分期构成存在显著差异(P<0.01)。11、腺癌13461例(84.3%),鳞癌1894例(11.9%),小细胞癌117例(0.7%),大细胞癌52例(0.3%),其他443例(2.8%);腺癌占比从75.6%增加至88.3%,鳞癌占比从21.5%下降至8.6%,不同年份病理类型构成存在显著差异(P<0.01);腺癌中,女性占比60.9%,鳞癌中,男性占比90.6%(P<0.01);腺癌发病高峰为50-59岁,鳞癌发病高峰为60-69岁(P<0.01);鳞癌BMI为低体重(<18.5 kg/m)或正常(18.5-23.9 kg/m)的占比较高(P<0.01);宣威、富源地区腺癌占比91.9%,其他地区腺癌占比81.1%(P<0.01);鳞癌患者吸烟率65.9%,腺癌患者吸烟率22.3%(P<0.01);腺癌患者0-Ⅰ期占比76.3%,鳞癌患者Ⅱ-Ⅲ期占比64.1%(P<0.01);鳞癌好发于左肺(P<0.01)。【结论】1、2013年-2022年昆明医科大学第三附属医院(云南省肿瘤医院)经手术治疗的肺癌病例数逐年增长,近5年增幅较大,云南地区腺癌是肺癌的主要病理类型。2、女性肺癌患者数量在2017年以后超过男性,腺癌中女性最常见,鳞癌中男性最常见。3、云南地区肺癌发病年龄呈现出年轻化趋势,腺癌发病高峰在50-59岁,鳞癌发病高峰在60-69岁。4、肺癌人群的平均BMI低于正常人群,鳞癌患者BMI低于其它病理亚型。5、曲靖市(尤其是宣威、富源地区)是云南省肺癌最为高发的地区,该地区腺癌占比高于其它地区。6、非吸烟肺癌患者占比增高,鳞癌仍常见于吸烟者。7、肺癌发病部位由高到低依次是右肺上叶、左肺上叶、右肺下叶、左肺下叶、右肺中叶,但鳞癌更好发于左肺上、下叶。8、胸腔镜手术逐年增加,单孔胸腔镜已成为最常用的手术技术。9、肺叶切除术比例下降,亚肺叶切除术比例增加。10、0-Ⅰ