关键词： 鸭坦布苏病毒   流行病学   分离鉴定   雏鸭   致病性  

摘要： 鸭坦布苏病毒（Duck Tembusu virus,DTMUV）在2010年我国东南沿海地区许多养鸭场爆发,这是该病毒首次被确定为导致鸭产蛋下降综合征的病原体。随后在几个月内蔓延到中国内陆地区,对我国禽类养殖业造成了巨大的经济损失。为调查贵州省三穗县鸭坦布苏病毒的流行情况和致病性情况,本实验室于2020-2021年期间在贵州省三穗县的多个养殖场采集血样和病料进行流行病学调查及病原检测分析,成功从临床样本中分离鉴定到一株鸭坦布苏病毒,命名为三穗株（GZSS2022）。此外,还通过雏鸭动物模型,此分离毒株对雏鸭有一定的致病性。1.鸭坦布苏病毒临床感染的血清流行病学调查及病原检测为调查贵州省三穗县鸭坦布苏病毒流行和感染情况,本实验室于2020-2021年期间在贵州省三穗县7个未接种坦布苏病毒疫苗养鸭场采集血样1170份和收集疑似临床样本366份。将自然感染病例制作病理切片,通过ELISA方法测定鸭坦布苏病毒抗体及RT-PCR检测其病原。研究结果显示,自然感染产蛋鸭卵泡充血出血,鸭脑组织病理组织切片观察到典型血管套现象,肝脏出现严重脂肪变性、毛细胆管扩张并充满胆色素,周围还有炎性细胞浸润的现象,抗体检测结果得到3个养鸭场出现抗体检测阳性,分别为7.4%、4.8%、3.6%,阳性样本主要出现在蛋鸭群,且多数阳性鸭为广东引进鸭源。病原检测RT-PCR共检测出12份鸭坦布苏病毒阳性样品,阳性率为3.3%,且三穗县自有品种三穗麻鸭也存在感染病例。初步鉴定贵州省三穗县有鸭坦布苏病毒感染情况,对后续鸭坦布苏病毒分离鉴定奠定坚实的基础。2.鸭坦布苏病毒的分离与鉴定及GZSS2022株鸭坦布苏病毒全基因组测定为了对贵州省三穗县鸭坦布苏病毒进行分离鉴定及全基因组序列测定,本研究将流调的阳性样本处理后制成匀浆液接种到10日龄SPF鸡胚传代进行病毒分离,将分离到的病毒尿囊液经RT-PCR、感染BHK-21细胞、感染细胞后制备透射电镜切片进行病毒鉴定。测定分离毒株的病毒滴度,最后扩增其全基因组序列并对其进行遗传进化分析。结果显示,接种鸡胚后有部分鸡胚死亡,死亡鸡胚出现全身出血和发育不良,连续传4代后,鸡胚死亡时间稳定。病毒尿囊液接种细胞48 h后开始观察到细胞病变现象,接毒后60 h达到高峰,细胞明显变圆、皱缩且密度降低,电镜切片观察到细胞质中存在40-60 nm大小的病毒颗粒,被囊泡包裹。病毒分离株TCID为10/0.1 m L,ELD为10/0.2 m L,测序所得11个片段结果拼接起来,得到该分离株全基因组序列,全长为10249 bp,与鸭坦布苏病毒同源性高达99.4%,确定分离病毒为鸭坦布苏病毒且命名为三穗株（GZSS2022株）。遗传进化分析发现GZSS2022株与泰国分离株处于同一大分枝,而与我国北京分离株在同一小分枝。***2022株鸭坦布苏病毒对鸭胚及雏鸭的致病性将分离的GZSS2022株接种鸭胚及7日龄雏鸭,病毒成功在鸭胚和雏鸭复制,观察鸭胚的病变情况,记录雏鸭的临床表现并对雏鸭进行剖检观察病理变化和制作病理切片,对病变内脏组织进行RT-PCR检测。结果显示,鸭胚在接毒后5天均死亡,鸭胚出现全身出血和发育异常,肝脏出现出血和坏死现象。动物试验雏鸭出现体温升高,黄色稀粪和神经症状,剖检雏鸭出现心肌出血,脾脏肿大,肝脏出血,在病理切片观察到了非化脓性脑炎的典型现象,脾窦出血和充血,胰腺细胞排列紊乱,可见淋巴细胞浸润,RT-PCR扩增出与预期大小相符的目的条带。综上所述,本研究通过对贵州省三穗县多个养鸭场进行流行病学调查,成功分离鉴定出一株鸭坦布苏病毒,命名为三穗株（GZSS2022）株,全基因组测序显示该病毒全长为10249 bp,动物试验表明GZSS2022株鸭坦布苏病毒对雏鸭具有一定的致病性。

关键词： 轮状病毒   流行病学特征   临床分析  

摘要： 目的:了解山西地区儿童轮状病毒胃肠炎的流行病学特征,分析临床特征及重型轮状病毒胃肠炎危险因素,以早期识别重症病例,提高轮状病毒胃肠炎临床诊治水平及防控,从而减轻疾病负担。方法:回顾性分析2018年01月至2021年12月于山西省儿童医院消化科住院治疗的急性腹泻病患儿病例,病例包含了山西省的11个地级市、117个县级行政单位,总结山西地区轮状病毒胃肠炎流行病学特点及临床特征,并分析重型轮状病毒胃肠炎危险因素。采用SPSS 22.0软件包对数据进行分析整理,组间率的比较采用卡方检验,Logistic回归分析危险因素,P<0.05差异有统计学意义。结果:2018年01月至2021年12月,因急性腹泻病入住消化科的住院患儿轮状病毒检出率为38.20%;时间分布,每年12月至次年2月是轮状病毒感染高峰季节,8月、9月、10月最低,差异有统计学意义(χ=762.507,P<0.05);年龄分布,轮状病毒肠炎平均年龄是(1.53±0.92)岁,1-≤2岁年龄组检出率最高(52.16%),6月-≤1岁年龄组次之,差异有统计学意义(χ=315.015,P<0.05);性别分布,男童检出率多于女童,比例为1.53:1,差异有统计学意义(χ=44.827,P<0.05);地区分布,居住于城镇检出率显著高于农村,差异有统计学意义(χ=39.256,P<0.05);喂养方式分布,≤6个月患儿中,非母乳喂养检出率高于母乳喂养,差异有统计学意义(χ=6.753,P<0.05);轮状病毒胃肠炎平均住院天数是(4.15±1.83)天,临床表现均为急性起病,主要表现为腹泻、呕吐、发热,常见合并症为脱水、代谢性酸中毒、电解质紊乱;轻型和重型轮状病毒胃肠炎在居住地区、年龄分组方面差异有统计学意义。经多因素分析,居住于乡村地区患儿发生重型轮状病毒胃肠炎的危险性是居住于城镇患儿的1.42倍。6月-≤1岁、1岁-≤2岁、1岁-≤2岁、>2岁发生重型轮状病毒胃肠炎的危险性分别是≤6月的1.98倍、2.33倍、2.24倍。结论:山西地区轮状病毒检出率偏高,高发季节是冬季,多见于6月-≤2岁的婴幼儿,男童比女童更易感染轮状病毒,居住于城镇相比农村更易感染。但居住于农村地区患儿更易发生重型轮状病毒胃肠炎。轮状病毒感染不仅可以引起胃肠道症状,还可引起肠道外症状,应根据其感染特点进行针对性的防控。

关键词： 下呼吸道感染   病原谱   儿童   COVID-19   流行病学   合胞病毒  

摘要： 目的:分析新型冠状病毒感染(coronavirus disease 2019,COVID-2019)疫情前和疫情期苏州地区下呼吸道感染住院儿童病原谱构成及临床特征变化,为本地区下呼吸道感染的临床诊治及防控提供依据。方法:(1)选取2018年2月1日至2022年1月31日苏州大学附属儿童医院呼吸科住院的下呼吸道感染患儿作为研究对象,按照病例入院时间分为新冠疫情前组(2018年2月1日至2020年1月31日)与新冠疫情期组(2020年2月1日至2022年1月31日),比较分析两组患儿病原谱的变化。(2)选取2018年2月1日至2022年1月31日苏州大学附属儿童医院下呼吸道感染住院患儿且鼻咽抽吸物或肺泡灌洗液病原学检测确定为呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)感染的患儿为研究对象,分析COVID-19疫情前和疫情期RSV感染患儿临床特征的变化。结果:第一部分COVID-19疫情前组和疫情期组下呼吸道感染住院儿童病原谱变化1.本研究共纳入患儿5901例,男3515(59.6%),女2386(40.4%),年龄中位数1.8岁。病原检出率56.02%(3306/5901),其中病毒检出率36.9%(2178/5901),细菌检出率 16.62%(981/5901),肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)检出率13.79%(814/5901),呼吸道病毒检出率最高,各组间差异有统计学意义(P<0.05)。单一病原排序前五位依次为:MP 13.79%、人鼻病毒(Human rhinovirus,HRV)12.09%、RSV 12.05%、肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae,SP)7.52%、人博卡病毒(Human bocavirus,HBoV)6.0%。MP感染最常见,组间比较有统计学意义(P<0.05)。2.3302例COVID-19疫情前组病原检出率58.9%(1944/3302),其中病毒检出率34.4%(1136/3302),细菌检出率 17.5%(579/3302),MP 检出率 20.3%(669/3302)。单一病原排序前五位依次为:MP 20.3%、RSV 11.8%、HRV 9.3%、SP 8.0%、HBoV 6.2%。MP感染最常见,组间比较有统计学意义(P<0.05)。3.2599例COVID-19疫情期组病原检出率52.4%(1362/2599),其中病毒检出率40.1%(1042/2599),细菌检出率 15.5%(402/2599),MP 检出率 5.6%(145/2599)。单一病原排序前五位依次为:HRV 15.6%、RSV 12.4%、SP 7.0%、副流感病毒(Parainfluenza virus,PIV)6.7%、HBoV 5.7%。HRV感染最常见,组间比较有统计学意义(P<0.05)。***-19疫情期组病原检出率低于疫情前组(52.4%vs 58.9%,P<0.001);其中病毒检出率高于疫情前组(40.1%vs 34.4%,P<0.001),细菌和MP检出率分别低于疫情前组(15.5%vs 17.5%,P=0.034;5.6%vs 20.3%,P<0.001)。***-19疫情期组HRV、PIV检出率高于疫情前组(15.6%vs 9.3%;6.7%vs 3.5%);疫情期组人偏肺病毒(Human partial pulmonary virus,hMPV)、腺病毒(Adenovirus,ADV)检出率低于疫情前组(2.1%vs 3.4%;1.0%vs 1.9%),差异均有统计学意义(P<0.05);疫情期组其它病原体RSV、HBoV、流感病毒(Influenza virus,Ⅳ)检出率与疫情前组无显著变化(12.4%vs 11.8%;6.2%vs 5.7%;1.2%vs 1.2%),差异无统计学意义(P>0.05)。***-19疫情期组卡他莫拉菌(Moraxella catarrhalis,MC)检出率高于疫情前组(4.7%vs 2.9%);流感嗜血杆菌(Haemophilus influenzae,HI)检出率低于疫情前组(3.4%vs 5.8%),差异均有统计学意义(P<0.05)。疫情期组其他细菌SP、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus,SA)检出率无变化(7.0%vs 8.0%;1.0%vs 1.2%),差异无统计学意义(P>0.05)。***-19疫情期组病原混合感染检出率低于疫情前组(14%vs 18.6%),差异有统计学意义(P<0.05)。疫情期组2种病原混合感染前五位依次为:RSV+SP 1.3%、HRV+SP 1.2%、HRV+

关键词： 猫传染性腹膜炎   猫冠状病毒   流行病学调查   遗传进化分析  

摘要： 猫传染性腹膜炎病毒(Feline infectious peritonitis virus,FIPV)是猫冠状病毒(Feline coronavirus,FCo V)的一种生物型,主要引起猫的传染性腹膜炎(Feline infectious peritonitis,FIP),FIP在猫中是一种严重的致死性疾病。自从上世纪60年代发现FIPV以来,该病对猫的健康造成了巨大的危害,目前为止尚无有效的疫苗和特异性的治疗方法来对疾病进行预防和控制。本研究通过对动物医院收集的疑似FIP病例的腹水及拭子样品进行荧光定量RT-PCR检测,对FIPV阳性样品进行部分S基因和N基因的RT-PCR扩增测序,进行遗传进化分析。本研究于2021-2022年间,在青岛地区多家宠物医院调查收集的149份疑似FIP病例的腹水样品中,通过荧光RT-PCR方法检测FIPV阳性样品为125份。回顾分析FIP与季节、年龄、性别、品种等因素的相关性,通过对四种因素的卡方检验结果可知,FIP发病与季节、猫的性别和品种关系不显著(P>0.05),FIP发病与猫的年龄有极显著的关系(P<0.01)。通过对2021年-2022年青岛地区采集的FIPV阳性的11份样品分别进行S2基因和N基因的RT-PCR扩增测序,对测序结果进行遗传进化分析,结果表明,11株阳性样品的FCo V生物型分型均属于FIPV生物型,而非FECV生物型;血清型分型属于II型FCo V。11株阳性样品相互之间亲缘关系较近,与参考株比较发现均与美国分离株亲缘关系较近,而与中国分离株亲缘关系较远。说明青岛地区2021年-2022年流行的FIPV毒株可能是由于国外毒株输入引起的,由于现在国际贸易频率增加,国外宠物不断输入国内市场,对我国宠物行业的健康发展、动物健康和动物疫病的预防工作带来了潜在风险。

关键词： tet(X4)   替加环素   水平传播   质粒   城市污水  

摘要： 研究背景:WHO发布的全球细菌耐药监测报告显示:2016年全球与耐药细菌感染有关的死亡人数约70万人,并预测到2050年这一数据将达1000万人/年,抗生素耐药性给公众健康和医疗救治带来极大的挑战。由于抗生素的滥用导致多重耐药菌的出现,并且在全世界广泛传播,替加环素在临床上用于多重耐药菌抗生素治疗而被称为最后的抗生素。而2019年发现的tet(X4)耐药基因,其常位于具有水平转移能力的质粒上,并且常与多种耐药基因共存,可通过质粒介导在不同细菌种内和种间传播并获得替加环素等多抗生素耐药性,这给公众健康造成极大威胁。研究目的:通过对广州市不同区、不同场所采集的污水样及分离的替加环素耐药菌进行tet(X4)基因的检测,获取全面的tet(X4)基因流行病学数据资料,阐明质粒介导替加环素耐药基因在广州市污水环境中的流行病学特征,分析其主要流行规律,探究可转移质粒类型上tet(X4)基因所在的基因环境及水平传播的影响。了解广州市替加环素耐药菌耐药性、亲缘关系、及其传播规律,为是否需要加大替加环素使用监控提供参考,为防控措施的制定提供科学依据。为动物临床或农业中合理使用替加环素类药物和控制耐药菌株的出现提供理论依据。材料与方法:本研究研究对象为2022年每月从广州市11个区和6个场所包括市场、医院、学校、污水厂、酒店以及社区采集的污水及所分离的替加环素耐药菌。调查污水样和替加环素耐药菌的tet(X4)基因的分布,使用基质解离飞行时间质谱法(MALDI-TOF MS)对替加环素耐药菌进行种属鉴定和亲缘关系分析,对tet(X4)阳性污水和tet(X4)阳性菌进行结合转移实验,对tet(X4)阳性菌以及结合子进行药敏试验及全基因组测序。在此基础上利用全基因组信息探究质粒介导的tet(X4)水平转移的特性。研究结果:2022年广州市11个区共采集1172份污水,经PCR鉴定后含有tet(X4)基因总体阳性率为42.24%(495/1167),1月至12月的tet(X4)基因阳性率为39.68%±17.11,tet(X4)在1月份和7-9月份检出率最高。11个采样区的阳性率为39.85%±11.21,其中花都区阳性率最高为52.28%(103/94),最低为黄埔区17.86%(5/28)。6个场所的阳性率为42.46%±11.24,其中污水处理厂和市场的阳性检出率最高为56.4%(123/216)、56.55%(82/145)。最低为学校,检出率分别为33.71%(59/175)。风险因素分析结果显示市场和污水厂、7-9月是tet(X4)基因检出的风险因素;总共分离出460株替加环素耐药菌其中包括铜绿假单胞菌113株、粪产碱杆菌69株、奇异变形杆菌62株、18株大肠杆菌、雷氏普罗维登斯菌48株、彭氏变形杆菌11株、斯氏普罗威登斯菌5株、摩根摩根菌株8株和3株恶臭假单胞菌,未成功鉴定123株。其中9株为tet(X4)阳性菌。包括6株大肠杆菌、1株变形杆菌、1株摩根摩根菌、首次分离携带tet(X4)基因的铜绿假单菌。利用污水培养液经接合转移实验获得19株结合子,tet(X4)阳性菌中只有2株大肠杆菌的质粒可以转入受体菌,接合成功率为22.22%。药敏试验显示分离的tet(X4)阳性菌均对氯霉素、替加环素和四环素耐药,除此外耐药最高的三种药物为链霉素88.89%、氨苄西林和复方新诺明均为66.67%,所有菌株对美罗培南、头孢他啶、阿卡米星和头孢他啶/阿维巴坦敏感,接和成功的结合子相比于受体菌获得了多种抗生素耐药性,结合子除替加环素外对四环素、链霉素、氯霉素耐药率最高分别为,95.24%、90.48%、95.24%,均对厄他培南、头孢他啶、阿卡米星和头孢他啶/阿维巴敏感。检测到tet(X4)基因位于6种不同类型的质粒上,大多数tet(X4)基因位于Inc X1(40.91%)型质粒上,检测到质粒的tet(X4)基因两端分别为IS91和IS1插入序列。研究结论:本研究发现污水中的tet(X4)阳性率在夏季和冬季较高,市场和污水厂是替加环素耐药性检测的重点场所。分离出460株替加环素耐药菌中铜绿假单胞菌、粪产碱杆菌和奇异变形杆菌最多,携带tet(X4)基因的细菌中最多为大肠杆菌。携带tet(X4)基因的细菌均对替加环素、四环素耐药,除此之外对链霉素和氯霉素耐药性较高,多重耐药性较严重。结合子能获得质粒上耐药基因的表型抗生素抗性。可转移的质粒中Inc X1型最多,IS91和IS1插入序列对tet(X4)基因的的转移起一定作用。

关键词： HCV   基因型   云南本地   境外输入   流行病学  

摘要： 丙型肝炎是由丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)引起的一种主要经血液传播的疾病,HCV感染可导致慢性肝炎、肝硬化甚至肝癌,已成为一个重大的公共卫生问题。据统计,全球约有1.7～2.0亿人感染了HCV,我国HCV感染者约占全球HCV感染总人口的14%,2016年,世界卫生组织(WHO)提出了到2030年消除病毒性肝炎的新全球目标。近年来,经济的全球化发展和人群的跨境流动增大了病毒传播和不同基因亚型病毒交流的风险与机会,促进了病毒的流行与传播。云南地处我国西南边陲,与东南亚多个国家接壤,由于特殊地理位置、民族群体多样性以及注射毒品的使用,云南成为HCV流行的主要地区之一,且云南HCV的跨境输入也时常发生。然而,目前对于云南境外输入HCV分子流行特征如何?云南境外输入与云南本地HCV分子流行特征差异如何?少有报道。因此,本文针对云南境外输入和云南本地HCV感染人群进行调查,阐明云南境外输入和云南本地基因型亚型的流行变化特征,比较云南境外输入和云南本地基因型亚型的流行变化特征,以及选择压力、分子传播网络和耐药相关突变的分析,对云南省HCV的监控和预防具有重要的意义,是促使我国实现世卫组织提出的2030年消除丙肝这一战略目标的重要一环。首先,共收集了2017-2019年境外输入云南HCV抗体阳性样本520例,其中52.1%的样本来自东南亚,少部分来自欧美、亚洲北部、南亚及非洲。本研究对E1区和NS5B区分别扩增并测序成功381例和455例,构建了系统发育进化树,根据建树结果进行基因分型,成功对511例样本进行分型。结果显示,3b亚型占比最大有25.24%(129/511),6n和1b分别占比15.66%(80/511)和11.55%(59/511),6xa占比8.61%(44/511),3a占比8.22%(42/511),1a占比7.44%(38/511),未分类的6亚型5.38%(28/511)以及混合感染4.31%(22/511)。2017-2019年三年间,GT3处于相对稳定增长的状态,2a、2b亚型占比相对较少,2a亚型先增后减并在2.19%-6.75%之间波动,1a亚型占比呈现下降趋势,1b亚型有一定上升趋势,6型和混合感染整体有所增长。对未分类的6型样本进行了近全长基因组的扩增,进行全长系统发育进化树分析显示,其中1例与已提交的序列KC844039、LC368421单独成簇,另外3例单独成簇,这几条序列与其他已分类的6亚型均无重组,序列间也无流行病学联系,计算遗传距离也显示符合新亚型命名的要求;因此将这两簇分别命名为6xk和6xl。对已分型的455例样本NS5B区进行耐药分析,结果显示,9.8%(50/455)的1b型患者发生了C316N/H的突变,0.4%(2/455)的1a型患者发生了C316Y/W的突变,均对达塞布韦产生抗性耐药;还有1例1b型和4例3b型患者中发生了S282T的突变,1例6xa患者发生了S282R的突变,一例3a型患者发生了S282T与V321G的联合突变,均对索磷布韦产生强烈的耐药性。其次,根据境外输入HCV样本数量,随机收集了2017-2019年云南地区HCV抗体阳性样本共500例,对E1区和NS5B区分别扩增并测序成功374例和371例,构建了系统发育进化树,根据建树结果进行基因分型,成功对445例样本进行分型。结果显示,3b亚型占比最大为39.8%(177/445),其次2a占17.5%(78/445),1b占12.6%(56/445),3a占12.6%(56/445),6n占9.7%(43/445)和6a占4.3%(19/445)。2017-2019年三年间,GT3占比一直位居第一,GT1有稳定下降的趋势,GT2先增后减呈现波动变化,GT6型和混合感染整体有所增长。对已分型的371例样本NS5B区进行耐药分析,13.2%(49/371)的1b型患者发生了C316N的突变,对达塞布韦产生抗性耐药,5例3b型患者中发现存在对索磷布韦具有很强的耐药性的S282T的突变,此外,在2a和3b亚型中还分别检测到1.1%(4/371)S289L和0.3%(1/371)V321A的突变,对索磷布韦产生抗性耐药。最后,本研究对2017-2019年云南本地与境外输入HCV基因型/亚型流行变化特征进行比较,结果显示2017-2019年间多个基因亚型流行率存在显著差异,发现1a、2a、6xa以及未分类6亚型的流行率存在极显著差异(p<0.001),3a、6n、6v、6xj亚型和混合感染的流行率存在显著差异(p<0.05);云南本地2a、3a、3b亚型占比在这三年一直比境外输入的高,相反,1a亚型和6型境外输入的占比较大,2b亚型仅在2017年境外输入人群中发现。对云南本地和境外输入HCV主要的

关键词： 水痘   流行病学特征   免疫规划  

摘要： 目的 分析贵阳市水痘流行病学特征，为制定合适的水痘防控措施和免疫接种策略提供科学依据。方法 通过中国疾病预防控制信息管理系统、贵州省免疫规划信息管理系统分别收集贵阳市水痘发病资料、常住人口资料及疫苗接种信息。采用描述性流行病学方法，对贵阳市2010—2022年水痘流行病学特征及水痘疫苗接种情况进行统计分析。结果贵阳市2010—2022年累积报告水痘病例32 405例，年均发病率54.39人/10万，<15岁人群发病数占比为75.46%;2011—2016年水痘发病情况相对稳定，之后除2017和2021年有所上升，整体呈下降趋势；女性发病人数占总人数比例呈上升趋势（S=56.000，τ=0.718,P<0.001）;0～<3岁发病率呈下降趋势，3～<5岁不断增加，5～<6岁达到高峰，之后逐渐下降；10～<15和15～<20岁全人群发病百分比呈不断增加的趋势；两个发病高峰分别是11月—次年1月和5—7月；观山湖区和白云区发病率高于其他区（市、县）；贵阳市历年水痘发病率与当年水痘疫苗二剂次的接种数量呈负相关（r=-0.610, P=0.027）。结论 贵阳市水痘发病整体呈下降趋势，具有明显的季节、地区及人群发病特征，发病以15岁以下学生为主。水痘疫苗第二剂次接种越好，发病率越低，故需要针对性加大力度推进入学入托水痘疫苗接种情况的查验，另一方面结合贵阳市10～<15、15～<20岁人群发病百分比不断增加的现象，需加强各年龄段学生水痘疫苗第二剂次的宣传及接种力度。

关键词： 诺如病毒   污水病毒富集   污水流行病学   分子流行病学  

摘要： 研究背景和目的诺如病毒(Norovirus,NoV)是引起非细菌性急性胃肠炎(Acute Gastroenteritis,AGE)的主要致病原,在全球范围内造成严重疾病负担。诺如病毒复杂的基因型别、高度的传染性(基于人群的R0=2)对开展全面、及时的病原分子监测提出挑战。本课题组前期研究已证明通过污水监测可以及时客观地反映人群诺如病毒的流行特征,是补充当前主要基于病例被动监测的重要手段。广东省是诺如病毒疫情的高发省份。近年,新诺如病毒变异型别如GⅡ.17,GⅡ.4在广东省首次发现并在全球流行。因此,广东省开展诺如病毒的分子监测对全球诺如病毒疫情预警具有重要意义。当前,我们对各种诺如病毒基因型在广东的动态流行规律以及不同区域诺如病毒的分布特征都缺乏系统研究,且基于临床病例监测难以开展。本研究在前期建立的污水诺如病毒测序及分析技术基础上,开展:①通过对2020-2021年广东省5个诺如病毒疫情高发城市环境污水中诺如病毒的分子监测,分析广东省不同区域的诺如病毒分子流行病学差异及动态变化;②建立高样本通量的自动化污水病毒富集浓缩方法,系统评估新方法检测污水病毒的灵敏度和精密度。研究结果将解析广东省重点区域人群的诺如病毒潜在流行特征及多个诺如病毒基因型的分子进化特征;建立的高样本通量污水病毒富集方法也将为未来新发传染病病原的分子监测提供新思路和技术支撑。研究方法1.2020-2021年,每月对广东省过往诺如病毒疫情高发的城市(广州、珠海、佛山、东莞、江门)开展一次环境污水的样本收集,采用阴离子膜吸附法结合超滤法二次浓缩进行病毒富集,使用RT-qPCR检测污水中NoV GⅠ、GⅡ基因组检出情况。对NoV的VP1片段进行半巢式PCR扩增,并基于Illumina MiSeq平台进行高通量测序,分析污水中GⅠ、GⅡ基因组的流行趋势及动态分布。2.建立磁珠法富集浓缩污水中病毒及核酸提取的自动化流程,利用数字PCR对肠道病毒毒株定量后作为标准品对磁珠法富集浓缩方法的灵敏度和精密度进行评价。研究结果1.2020-2021年,广东省5个NoV疫情高发城市NoV污水中GⅠ基因组总检出率为82.30%(93/113),GⅡ基因组总检出率为85.84%(97/113)。2.广东省不同区域流行的诺如基因型别不完全相同。对于GⅠ基因组,共测出8种基因型,除东莞市以GⅠ.3、GⅠ.4、GⅠ.5为主,其余4个监测城市均以GⅠ.1、GⅠ.3及GⅠ.5为主。对于GⅡ基因组,共测出12种GⅡ基因型,佛山市以GⅡ.2、GⅡ.3及GⅡ.17为主导基因型,其余4个监测城市均以GⅡ.2、GⅡ.4、GⅡ.17为流行型别;GⅡ.4基因型分布比例在2021年9月开始升高,并且在9-12月成为优势流行型别。3.GⅡ.2、GⅡ4、GⅡ.17是广东省主要流行基因型,这些基因型在区域内存在多个变异株共流行。.污水序列中GⅡ.2基因型均为GⅡ.2[P16]重组株;GⅡ.17主要为GⅡ.17 Kawasaki2014,GⅡ.17[P31]在多个区域污水中仍有检出;GⅡ.4基因型主要为GⅡ.4 Sydney[P16]。其中,引起2021年底GⅡ.4基因型分布比例升高的进化分支主要为 GⅡ.4 Sydney[P16]及 GⅡ.4 Sydney 2012。4.应用磁珠法富集浓缩污水中病毒及核酸提取,自动化流程的批内重复性变异系数介于0.71%-1.96%,对EV71的检测灵敏度可达100 copies/mL,可在1h内完成污水病毒的浓缩富集、核酸提取。研究结论1.基于前期建立的高通量测序的环境污水监测技术,2020-2021年广东省5个监测城市污水中NoV仍然保持高检出率,基因型分布呈现遗传多样性,存在不同基因型的共同流行。2.污水监测基因型丰度变化和序列系统进化分析结果表明,经过2013-2018年GⅡ.17变异株和GⅡ.2重组株的暴发流行后,GⅡ.4可能重新成为人群的主要流行型别。3.通过磁珠法富集污水中的诺如病毒及新冠病毒都具有较高灵敏度和可重复性,可以在短时间内完成自动化多个样本的病毒富集,可为后期开展新发传染病病原污水监测工作提供重要的技术支持。

关键词： 创伤中心   创伤   流行病学  

摘要： 目的 分析某医院创伤中心创伤患者的临床特征及救治情况，为降低创伤事件的发生，指导医疗资源合理分配，提高救治水平提供参考。方法 选取2021年1-12月医院创伤中心收治的833例患者为调查对象。通过创伤中心患者登记表获取信息，包括性别、年龄、诊断、收治情况等，采用SPSS26.0统计学软件进行数据分析。结果 创伤中心救治的男性患者548例（65.79%），女性患者285例（34.21%）；平均年龄55.18±15.19岁，创伤事件患者以51～60岁年龄组占比最高（34.81%）；创伤事件一年内发生月份的峰值为5月和11月份；创伤事件24小时内发生时间的峰值为上午10时和下午15时；受伤部位主要为四肢、头颈部、胸部、腹部；收治创伤患者前三的科室为创伤科465人（55.82%）、脑外科119人（14.29%）、胸外科84人（10.08%）。结论 创伤患者在人群、月份、时点的分布有相对明显的规律，可以针对高危人群、高峰月份、时点加强劳动安全宣传和人群安全防范意识以及进行医疗资源整合和人员配置优化，从而降低创伤事件的发生、提升创伤救治效率、降低创伤的致死率及致残率。